Përgjegjëse për zbatimin e ligjshmërisë në respektimin e normave dhe standarteve në fushën e planifikimit, zhvillimit, mbrojtjes së territorit e disiplinimit të punimeve në ndërtim, menaxhimit të integruar të burimeve ujore, mbikëqyrjen dhe kontrollin ndaj Inspektorateve të Inspektoratit të Mbrojtjes së Territorit në nivel qarku, inspektimin e materialeve dhe produkteve të ndërtimit që hidhen në treg, inspektimin e shfrytëzimit të karrierave të nxjerrjes së materialeve të ndërtimit.
Përgjegjëse për zbatimin e ligjshmërisë në respektimin e normave dhe standarteve në fushën e planifikimit, zhvillimit, mbrojtjes së mjedisit dhe burimeve ujore, menaxhimit të integruar të burimeve ujore, mbikqyrjen dhe kontrollin, inspektimin e shfrytëzimit të karrierave të nxjerrjes së materialeve të ndërtimit dhe për puset e ujit
Mbulon veprimtarinë për ushtrimin e përgjegjësive të inspektimit mbi zbatimin e ligjshmërisë në këto drejtime kryesore: Të garantojë mbrojtjen dhe sigurinë e pyjeve përmes parandalimit, zbulimit dhe hetimit të veprave penale kundër pyjeve dhe procedimit penal të autorëve të tyre në përputhje me parashikimet e legjislacionit penal. Të bashkëpunojë me strukturat përgjegjëse për kontrollin në pyje sipas ligjit përkatës dhe mbështesin ato sipas kërkesës dhe nevojës.
Përgjegjëse për mbarëvajtjen e veprimtarisë së institucionit, grumbullimit, përpunimit dhe koordinimit të veprimarisë së aktivitetit të këtij Institucioni me institucione të tjera ligjzbatuese e konstatuese. Mbledh informacion në mënyrë të vazhdueshme nga të gjitha drejtoritë e tjera dhe prodhon raporte periodike në mbështetje të analizës së plotë të punës të I.K.M.T – së, ofron informacion për publikun dhe institucione të tjera publike apo të huaja sipas kërkesave të marra. Mbështet politikat / aktivitetet sensibilizuese të IKMT- së për mbrojtjen e mjedisit dhe territorit.
Ka mision të rregullojë dhe të kryejë të gjithë veprimtarinë juridike dhe legjislative në përputhje me dispozitat ligjore në fuqi, përmirësimin e kuadrit ligjor përkatës, si dhe përfaqësimin ligjor të institucionit në procese gjyqësore dhe në marrëdhënie me të tretët.
Përgjegjës për organizimin në aspektin praktik të ndërhyrjeve dhe ekzekutimeve në terren, për zbatimin e vendimeve të IKMT – së me objekt: pezullimin e punimeve të ndërtimit, prishjen e ndërtimeve të paligjshme apo sekuestrimin e mjeteve të punës dhe makinerive, etj
Drejtoria e Financës dhe Shërbimeve Mbështetëse është struktura përgjegjëse për mbarëvajtjen e veprimtarisë së institucionit, në aspektin administrativ e financiar, për trajtimin e informacioneve, praktikave apo proçedurave të ardhura nga shërbimi përmbarimor referuar titujve ekzekutiv në proçes e deri në likujdimin total, funksionimin optimal të shërbimeve mbështetëse e logjistike, në përputhje me nevojat parësore të institucionit, si dhe menaxhimin e burimeve njerëzore dhe kapaciteve profrsionale sipas nevojave të institucionit dhe në përputhje me legjislacionin që rregullon marrëdhënien e punës.